Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ly6c1P0CW02 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ly6c1P0CW02 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms