Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Jmjd7P0C872 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Jmjd7P0C872 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Jmjd7P0C872 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms