Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Surf1P09925 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Surf1P09925 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Surf1P09925 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Surf1P09925 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf1P09925 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf1P09925 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Surf1P09925 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Surf1P09925 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms