Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa1P09022 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa1P09022 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms