Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa5P09021 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa5P09021 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms