Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col4a2P08122 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a2P08122 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a2P08122 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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