Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col3a1P08121 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col3a1P08121 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms