Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spta1P08032 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spta1P08032 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Spta1P08032 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Spta1P08032 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms