Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06335 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06335 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06335 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06335 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06335 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06335 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06335 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06335 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06335 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06335 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms