Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P06330 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06330 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06330 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15□□□□□ -0.01
P06330 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06330 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
P06330 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P06330 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P06330 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P06330 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P06330 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P06330 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P06330 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P06330 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P06330 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P06330 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P06330 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms