Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06323 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P06323 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06323 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P06323 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06323 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P06323 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06323 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06323 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06323 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06323 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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