Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd3dP04235 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd3dP04235 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd3dP04235 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd3dP04235 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd3dP04235 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms