Protein–RNA interactions for Protein: P01915

H-2 class II histocompatibility antigen, E-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01915 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01915 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01915 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01915 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01915 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01915 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01915 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01915 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01915 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01915 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01915 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms