Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01798 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01798 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01798 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01798 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01798 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01798 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01798 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01798 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01798 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01798 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01798 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01798 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01798 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01798 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01798 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01798 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01798 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01798 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01798 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01798 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01798 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01798 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms