Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01789 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01789 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01789 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01789 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01789 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01789 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01789 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01789 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms