Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01786 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01786 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01786 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01786 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01786 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01786 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01786 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01786 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01786 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01786 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01786 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01786 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01786 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01786 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01786 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01786 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01786 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01786 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01786 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01786 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01786 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms