Protein–RNA interactions for Protein: P01728

Ig lambda-2 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01728 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01728 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01728 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01728 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01728 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01728 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01728 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01728 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01728 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01728 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01728 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01728 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01728 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01728 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms