Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01667 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01667 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01667 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01667 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01667 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01667 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01667 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01667 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01667 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01667 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01667 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01667 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01667 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
P01667 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01667 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01667 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01667 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01667 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01667 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01667 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01667 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01667 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01667 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01667 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P01667 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01667 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
P01667 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01667 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01667 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms