Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01662 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01662 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01662 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01662 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01662 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01662 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01662 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01662 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01662 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01662 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
P01662 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01662 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01662 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P01662 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01662 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P01662 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P01662 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01662 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01662 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01662 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01662 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01662 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P01662 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P01662 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01662 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01662 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01662 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01662 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01662 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01662 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P01662 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01662 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01662 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01662 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P01662 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01662 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01662 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01662 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P01662 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms