Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01658 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01658 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01658 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01658 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01658 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01658 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01658 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01658 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01658 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01658 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms