Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Odc1P00860 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Odc1P00860 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Odc1P00860 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Odc1P00860 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Odc1P00860 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms