Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lancl1O89112 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lancl1O89112 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms