Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccl20O89093 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccl20O89093 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccl20O89093 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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