Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp1O89090 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp1O89090 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sp1O89090 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp1O89090 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp1O89090 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp1O89090 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms