Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pde4aO89084 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pde4aO89084 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pde4aO89084 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms