Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Apaf1O88879 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apaf1O88879 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms