Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd160O88875 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd160O88875 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd160O88875 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cd160O88875 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms