Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tom1O88746 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tom1O88746 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tom1O88746 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tom1O88746 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tom1O88746 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tom1O88746 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tom1O88746 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tom1O88746 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tom1O88746 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Tom1O88746 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tom1O88746 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tom1O88746 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tom1O88746 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms