Protein–RNA interactions for Protein: O88728

Ifitm5, Interferon-induced transmembrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm5O88728 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifitm5O88728 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm5O88728 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms