Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hcn2O88703 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hcn2O88703 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hcn2O88703 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms