Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
BlmO88700 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BlmO88700 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BlmO88700 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BlmO88700 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BlmO88700 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
BlmO88700 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BlmO88700 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
BlmO88700 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
BlmO88700 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
BlmO88700 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BlmO88700 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
BlmO88700 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BlmO88700 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BlmO88700 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BlmO88700 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
BlmO88700 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
BlmO88700 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
BlmO88700 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BlmO88700 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BlmO88700 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
BlmO88700 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
BlmO88700 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BlmO88700 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
BlmO88700 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
BlmO88700 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
BlmO88700 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BlmO88700 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
BlmO88700 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BlmO88700 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BlmO88700 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
BlmO88700 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BlmO88700 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BlmO88700 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BlmO88700 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BlmO88700 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BlmO88700 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BlmO88700 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BlmO88700 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
BlmO88700 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
BlmO88700 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BlmO88700 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BlmO88700 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BlmO88700 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BlmO88700 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
BlmO88700 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
BlmO88700 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BlmO88700 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BlmO88700 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
BlmO88700 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
BlmO88700 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BlmO88700 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
BlmO88700 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
BlmO88700 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BlmO88700 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BlmO88700 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BlmO88700 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
BlmO88700 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BlmO88700 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BlmO88700 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
BlmO88700 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BlmO88700 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
BlmO88700 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
BlmO88700 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BlmO88700 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
BlmO88700 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
BlmO88700 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms