Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Mmp23O88676 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mmp23O88676 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Mmp23O88676 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mmp23O88676 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mmp23O88676 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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