Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3fO88632 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3fO88632 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms