Protein–RNA interactions for Protein: O88491

Nsd1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd1O88491 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nsd1O88491 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nsd1O88491 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsd1O88491 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsd1O88491 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nsd1O88491 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nsd1O88491 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsd1O88491 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nsd1O88491 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsd1O88491 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsd1O88491 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Nsd1O88491 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsd1O88491 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Nsd1O88491 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nsd1O88491 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nsd1O88491 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Nsd1O88491 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Nsd1O88491 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nsd1O88491 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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