Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nme6O88425 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nme6O88425 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms