Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AvilO88398 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AvilO88398 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AvilO88398 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AvilO88398 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AvilO88398 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AvilO88398 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AvilO88398 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AvilO88398 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AvilO88398 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AvilO88398 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AvilO88398 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AvilO88398 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AvilO88398 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AvilO88398 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AvilO88398 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AvilO88398 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AvilO88398 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AvilO88398 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AvilO88398 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AvilO88398 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AvilO88398 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AvilO88398 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms