Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sorl1O88307 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms