Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Srpk1O70551 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Srpk1O70551 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Srpk1O70551 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms