Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb5O55234 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Psmb5O55234 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms