Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2a2O55143 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp2a2O55143 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms