Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PrxO55103 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrxO55103 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrxO55103 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PrxO55103 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PrxO55103 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrxO55103 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrxO55103 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrxO55103 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrxO55103 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrxO55103 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrxO55103 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrxO55103 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrxO55103 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrxO55103 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrxO55103 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrxO55103 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrxO55103 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrxO55103 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PrxO55103 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrxO55103 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrxO55103 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrxO55103 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrxO55103 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrxO55103 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrxO55103 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrxO55103 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrxO55103 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrxO55103 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrxO55103 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrxO55103 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrxO55103 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrxO55103 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrxO55103 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrxO55103 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrxO55103 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrxO55103 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrxO55103 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PrxO55103 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PrxO55103 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PrxO55103 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PrxO55103 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrxO55103 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrxO55103 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrxO55103 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PrxO55103 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrxO55103 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrxO55103 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrxO55103 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrxO55103 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrxO55103 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrxO55103 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrxO55103 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrxO55103 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrxO55103 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrxO55103 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PrxO55103 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrxO55103 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms