Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trappc3O55013 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trappc3O55013 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms