Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SlkO54988 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SlkO54988 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SlkO54988 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SlkO54988 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SlkO54988 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlkO54988 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlkO54988 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlkO54988 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlkO54988 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SlkO54988 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SlkO54988 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SlkO54988 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SlkO54988 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SlkO54988 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SlkO54988 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SlkO54988 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SlkO54988 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SlkO54988 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SlkO54988 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SlkO54988 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SlkO54988 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SlkO54988 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms