Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Itgb3O54890 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Itgb3O54890 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms