Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjd2O54851 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjd2O54851 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjd2O54851 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms