Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brs3O54798 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brs3O54798 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brs3O54798 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Brs3O54798 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brs3O54798 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brs3O54798 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Brs3O54798 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms