Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FxnO35943 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FxnO35943 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FxnO35943 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FxnO35943 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FxnO35943 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FxnO35943 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FxnO35943 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FxnO35943 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FxnO35943 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FxnO35943 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FxnO35943 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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FxnO35943 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FxnO35943 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FxnO35943 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FxnO35943 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FxnO35943 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FxnO35943 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FxnO35943 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FxnO35943 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FxnO35943 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FxnO35943 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FxnO35943 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FxnO35943 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FxnO35943 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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