Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5r2O35926 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk5r2O35926 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms