Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl25O35903 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms