Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppfibp2O35711 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppfibp2O35711 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms